Будущее актёра было предопределено ещё до его рождения, так как его родители, а также бабушка и дедушка имели к кинематографу самое прямое отношение начиная с начала прошлого века. В частности Матильды Муньос (бабушка) знаменитая актриса, а Рафаэль Бардем (дедушка) известный режиссёр прошлого столетия.
Несмотря на то, что уже в шестилетнем возрасте Хавьер снялся в своей первой кинокартине, он не сразу пошёл по проторенному предками пути, хотя любовь к театру и кино были на лицо. Поначалу мальчик увлёкся живописью и даже посвятил этому искусству несколько лет. Он учился в художественной школе, а для того, чтобы иметь возможность платить за учёбу иногда снимался в фильмах. Хавьер лелеял в душе мечту стать великим живописцем, но когда понял, что это у него не получится, то переключился на своё, до того момента второстепенное занятие — кино.
Настоящим серьёзным дебютом оказалась роль в кинофильме «Возрасты Лулу» (1990 г.), где он сыграл одну из второстепенных ролей. Игра начинающего, двадцатилетнего актёра впечатлила Бигаса Луну и он пригласил его в свой следующий комедийный фильм «Ветчина, ветчина», который стал известным не только на родине Хавьера и получил «Серебрянного льва» на Венецианском кинофестивале. Тогда же молодой актёр в первый раз встретился с, только начинающей актёрскую карьеру шестнадцатилетней Пенелопой Крус.
Брутального, харизматического актёра с загадочными томными глазами, начали приглашать в картины провокационного характера - комедийная драма «Золотые яйца» (1993 г.), драма «Экстаз» (1990 г.)детективный триллер «Между ног» (1999 г.). В свете ошеломляющего успеха фильмов с участием Хавьера Бардема, ему уже можно было выходить на мировую киноарену, но препятствием было плохое знание английского языка. Он достаточно быстро ликвидировал этот недостаток и уже в 1997-м благодаря соотечественнику уже закрепившемуся в Голливуде снялся в картине «Пердита Дуранго) сыграв одну из главных ролей. Режиссёры и продюсеры видели в нём этакого ловеласа, любимчика женщин, но ему хотелось проявить себя в другом амплуа и это ему удалось в картине «Пока не наступит завтра» где он выступил в роли поэта с нетрадиционной ориентацией. Даже сам Аль Пачино восхитился его игрой, позвонив ему по телефону. Хавьер сохранил запись этого разговора на память.
После двух, ни к чему не обязывающих романов, Бардем наконец вновь встретил Пенелопу Крус. Взаимное чувство и публичное предложение руки и сердца на Каннском кинофестивале, соединило два любящих сердца. В 2010-м состоялась свадьба на Багамах. Спустя год, Пенелопа подарила супругу сына Леонардо, а по прошествии двух лет дочь, которую назвали Луной.